Pakkauspaperin varastoinnissa on otettava huomioon useita tekijöitä sen laadun varmistamiseksi.
Mitä tulee lämpötilaan, se on pidettävä 10 asteen ja 30 asteen välillä. Liiallinen lämpötila voi aiheuttaa paperin vääntymisen ja liiman pehmenemisen; liian alhainen lämpötila tekee paperista hauraan ja vaurioituu helposti.
Kosteuden hallinta on ratkaisevan tärkeää; suhteellinen kosteus tulisi ihanteellisesti pitää välillä 40 % - 60 %. Liiallinen kosteus voi saada paperin kosteaksi ja homehtumaan ja sen lujuuden heikkenemään; Liian alhainen kosteus voi aiheuttaa paperin kuivumista ja halkeilua sekä staattista sähköä.
Varastointiympäristö tulee pitää puhtaana ja hyvin{0}}tuuletettuna, välttäen pölyn ja roskien kerääntymistä pakkauspaperin saastumisen estämiseksi. Se tulee myös pitää poissa vesilähteistä ja syövyttävistä aineista kosteuden ja korroosion estämiseksi.
Säilytyksen aikana pakkauspaperi on pinottava siististi puristumisen ja muodonmuutosten välttämiseksi. Erikoismuotoisille tai -rakenteisille paperille voidaan käyttää erityisiä hyllyjä tai erillisiä säilytystiloja. Lisäksi on ryhdyttävä hyönteisten ja jyrsijöiden torjuntatoimiin, kuten hyönteiskarkotteiden sijoittamiseen, jotta estetään paperipussien ja laatikoiden vaurioituminen.
